Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrrdQ8K2M3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrrdQ8K2M3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrrdQ8K2M3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrrdQ8K2M3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrdQ8K2M3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrdQ8K2M3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrdQ8K2M3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrrdQ8K2M3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrrdQ8K2M3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrrdQ8K2M3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SrrdQ8K2M3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrrdQ8K2M3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SrrdQ8K2M3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrdQ8K2M3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrrdQ8K2M3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrrdQ8K2M3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrrdQ8K2M3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrrdQ8K2M3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrrdQ8K2M3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrrdQ8K2M3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrrdQ8K2M3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrrdQ8K2M3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrrdQ8K2M3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrrdQ8K2M3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrrdQ8K2M3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrrdQ8K2M3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrrdQ8K2M3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrrdQ8K2M3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrrdQ8K2M3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrrdQ8K2M3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrrdQ8K2M3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrrdQ8K2M3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SrrdQ8K2M3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrrdQ8K2M3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrdQ8K2M3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrdQ8K2M3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrdQ8K2M3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrdQ8K2M3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrdQ8K2M3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SrrdQ8K2M3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrrdQ8K2M3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrrdQ8K2M3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrrdQ8K2M3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrdQ8K2M3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrdQ8K2M3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrdQ8K2M3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrrdQ8K2M3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrrdQ8K2M3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrrdQ8K2M3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrrdQ8K2M3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrrdQ8K2M3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrrdQ8K2M3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrrdQ8K2M3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrrdQ8K2M3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrrdQ8K2M3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrrdQ8K2M3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SrrdQ8K2M3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrrdQ8K2M3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SrrdQ8K2M3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrrdQ8K2M3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrrdQ8K2M3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrrdQ8K2M3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrrdQ8K2M3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SrrdQ8K2M3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrrdQ8K2M3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrdQ8K2M3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrdQ8K2M3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrrdQ8K2M3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrdQ8K2M3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrrdQ8K2M3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrrdQ8K2M3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms