Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2J7

Rell1, RELT-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rell1Q8K2J7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rell1Q8K2J7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rell1Q8K2J7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rell1Q8K2J7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rell1Q8K2J7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rell1Q8K2J7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rell1Q8K2J7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rell1Q8K2J7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rell1Q8K2J7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rell1Q8K2J7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rell1Q8K2J7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rell1Q8K2J7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rell1Q8K2J7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rell1Q8K2J7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rell1Q8K2J7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rell1Q8K2J7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rell1Q8K2J7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rell1Q8K2J7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rell1Q8K2J7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rell1Q8K2J7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rell1Q8K2J7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rell1Q8K2J7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rell1Q8K2J7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rell1Q8K2J7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rell1Q8K2J7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rell1Q8K2J7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rell1Q8K2J7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rell1Q8K2J7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rell1Q8K2J7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rell1Q8K2J7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rell1Q8K2J7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Rell1Q8K2J7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rell1Q8K2J7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rell1Q8K2J7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rell1Q8K2J7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rell1Q8K2J7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rell1Q8K2J7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rell1Q8K2J7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rell1Q8K2J7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rell1Q8K2J7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rell1Q8K2J7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rell1Q8K2J7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rell1Q8K2J7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rell1Q8K2J7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rell1Q8K2J7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rell1Q8K2J7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rell1Q8K2J7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rell1Q8K2J7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rell1Q8K2J7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rell1Q8K2J7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rell1Q8K2J7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rell1Q8K2J7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rell1Q8K2J7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rell1Q8K2J7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rell1Q8K2J7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rell1Q8K2J7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rell1Q8K2J7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rell1Q8K2J7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rell1Q8K2J7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rell1Q8K2J7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rell1Q8K2J7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rell1Q8K2J7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rell1Q8K2J7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rell1Q8K2J7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rell1Q8K2J7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rell1Q8K2J7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rell1Q8K2J7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rell1Q8K2J7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rell1Q8K2J7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rell1Q8K2J7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rell1Q8K2J7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rell1Q8K2J7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rell1Q8K2J7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rell1Q8K2J7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rell1Q8K2J7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rell1Q8K2J7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rell1Q8K2J7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rell1Q8K2J7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rell1Q8K2J7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rell1Q8K2J7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rell1Q8K2J7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rell1Q8K2J7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rell1Q8K2J7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rell1Q8K2J7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rell1Q8K2J7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rell1Q8K2J7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rell1Q8K2J7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rell1Q8K2J7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms