Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZR5

CMTM4, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4Q8IZR5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTM4Q8IZR5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTM4Q8IZR5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTM4Q8IZR5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTM4Q8IZR5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMTM4Q8IZR5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMTM4Q8IZR5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMTM4Q8IZR5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMTM4Q8IZR5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMTM4Q8IZR5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMTM4Q8IZR5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CMTM4Q8IZR5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CMTM4Q8IZR5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CMTM4Q8IZR5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMTM4Q8IZR5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CMTM4Q8IZR5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CMTM4Q8IZR5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMTM4Q8IZR5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMTM4Q8IZR5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMTM4Q8IZR5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMTM4Q8IZR5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMTM4Q8IZR5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTM4Q8IZR5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTM4Q8IZR5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM4Q8IZR5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM4Q8IZR5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM4Q8IZR5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CMTM4Q8IZR5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTM4Q8IZR5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTM4Q8IZR5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMTM4Q8IZR5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMTM4Q8IZR5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMTM4Q8IZR5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMTM4Q8IZR5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMTM4Q8IZR5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMTM4Q8IZR5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM4Q8IZR5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM4Q8IZR5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM4Q8IZR5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM4Q8IZR5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM4Q8IZR5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM4Q8IZR5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMTM4Q8IZR5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMTM4Q8IZR5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMTM4Q8IZR5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMTM4Q8IZR5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMTM4Q8IZR5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMTM4Q8IZR5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMTM4Q8IZR5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMTM4Q8IZR5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CMTM4Q8IZR5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMTM4Q8IZR5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMTM4Q8IZR5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMTM4Q8IZR5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMTM4Q8IZR5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMTM4Q8IZR5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMTM4Q8IZR5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM4Q8IZR5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM4Q8IZR5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM4Q8IZR5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM4Q8IZR5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM4Q8IZR5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM4Q8IZR5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM4Q8IZR5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMTM4Q8IZR5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMTM4Q8IZR5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM4Q8IZR5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM4Q8IZR5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms