Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZL9

CDK20, Cyclin-dependent kinase 20, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK20Q8IZL9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK20Q8IZL9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK20Q8IZL9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK20Q8IZL9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK20Q8IZL9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK20Q8IZL9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK20Q8IZL9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK20Q8IZL9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK20Q8IZL9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK20Q8IZL9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK20Q8IZL9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK20Q8IZL9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK20Q8IZL9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK20Q8IZL9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK20Q8IZL9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK20Q8IZL9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK20Q8IZL9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK20Q8IZL9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK20Q8IZL9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK20Q8IZL9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK20Q8IZL9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK20Q8IZL9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK20Q8IZL9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK20Q8IZL9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK20Q8IZL9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK20Q8IZL9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK20Q8IZL9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK20Q8IZL9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK20Q8IZL9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK20Q8IZL9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK20Q8IZL9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK20Q8IZL9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK20Q8IZL9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK20Q8IZL9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK20Q8IZL9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK20Q8IZL9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK20Q8IZL9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK20Q8IZL9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK20Q8IZL9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK20Q8IZL9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK20Q8IZL9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK20Q8IZL9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK20Q8IZL9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK20Q8IZL9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK20Q8IZL9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK20Q8IZL9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK20Q8IZL9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK20Q8IZL9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK20Q8IZL9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK20Q8IZL9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK20Q8IZL9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK20Q8IZL9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK20Q8IZL9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms