Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNTD2Q8IXW0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNTD2Q8IXW0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMNTD2Q8IXW0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNTD2Q8IXW0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNTD2Q8IXW0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNTD2Q8IXW0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNTD2Q8IXW0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNTD2Q8IXW0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNTD2Q8IXW0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMNTD2Q8IXW0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNTD2Q8IXW0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNTD2Q8IXW0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMNTD2Q8IXW0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMNTD2Q8IXW0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNTD2Q8IXW0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNTD2Q8IXW0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNTD2Q8IXW0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMNTD2Q8IXW0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMNTD2Q8IXW0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNTD2Q8IXW0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNTD2Q8IXW0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNTD2Q8IXW0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNTD2Q8IXW0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNTD2Q8IXW0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMNTD2Q8IXW0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LMNTD2Q8IXW0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNTD2Q8IXW0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNTD2Q8IXW0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNTD2Q8IXW0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNTD2Q8IXW0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNTD2Q8IXW0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNTD2Q8IXW0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNTD2Q8IXW0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNTD2Q8IXW0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNTD2Q8IXW0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNTD2Q8IXW0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNTD2Q8IXW0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms