Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRLF3Q8IUI8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRLF3Q8IUI8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRLF3Q8IUI8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRLF3Q8IUI8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRLF3Q8IUI8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRLF3Q8IUI8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRLF3Q8IUI8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRLF3Q8IUI8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRLF3Q8IUI8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRLF3Q8IUI8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRLF3Q8IUI8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRLF3Q8IUI8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRLF3Q8IUI8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRLF3Q8IUI8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRLF3Q8IUI8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRLF3Q8IUI8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRLF3Q8IUI8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRLF3Q8IUI8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRLF3Q8IUI8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRLF3Q8IUI8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRLF3Q8IUI8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRLF3Q8IUI8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRLF3Q8IUI8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRLF3Q8IUI8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRLF3Q8IUI8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRLF3Q8IUI8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRLF3Q8IUI8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRLF3Q8IUI8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRLF3Q8IUI8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRLF3Q8IUI8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRLF3Q8IUI8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRLF3Q8IUI8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRLF3Q8IUI8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRLF3Q8IUI8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRLF3Q8IUI8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRLF3Q8IUI8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRLF3Q8IUI8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRLF3Q8IUI8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRLF3Q8IUI8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRLF3Q8IUI8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CRLF3Q8IUI8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CRLF3Q8IUI8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRLF3Q8IUI8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRLF3Q8IUI8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRLF3Q8IUI8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CRLF3Q8IUI8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRLF3Q8IUI8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRLF3Q8IUI8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRLF3Q8IUI8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRLF3Q8IUI8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRLF3Q8IUI8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRLF3Q8IUI8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRLF3Q8IUI8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CRLF3Q8IUI8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRLF3Q8IUI8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRLF3Q8IUI8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRLF3Q8IUI8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRLF3Q8IUI8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRLF3Q8IUI8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRLF3Q8IUI8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms