Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rftn2Q8CHX7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rftn2Q8CHX7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rftn2Q8CHX7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rftn2Q8CHX7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rftn2Q8CHX7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rftn2Q8CHX7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rftn2Q8CHX7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rftn2Q8CHX7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rftn2Q8CHX7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rftn2Q8CHX7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rftn2Q8CHX7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rftn2Q8CHX7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rftn2Q8CHX7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rftn2Q8CHX7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rftn2Q8CHX7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rftn2Q8CHX7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rftn2Q8CHX7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rftn2Q8CHX7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rftn2Q8CHX7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rftn2Q8CHX7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rftn2Q8CHX7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rftn2Q8CHX7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rftn2Q8CHX7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rftn2Q8CHX7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rftn2Q8CHX7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rftn2Q8CHX7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rftn2Q8CHX7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rftn2Q8CHX7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rftn2Q8CHX7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rftn2Q8CHX7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rftn2Q8CHX7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rftn2Q8CHX7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rftn2Q8CHX7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rftn2Q8CHX7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rftn2Q8CHX7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rftn2Q8CHX7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rftn2Q8CHX7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rftn2Q8CHX7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rftn2Q8CHX7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rftn2Q8CHX7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rftn2Q8CHX7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rftn2Q8CHX7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rftn2Q8CHX7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rftn2Q8CHX7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rftn2Q8CHX7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rftn2Q8CHX7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rftn2Q8CHX7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rftn2Q8CHX7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rftn2Q8CHX7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rftn2Q8CHX7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rftn2Q8CHX7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rftn2Q8CHX7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rftn2Q8CHX7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rftn2Q8CHX7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rftn2Q8CHX7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rftn2Q8CHX7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rftn2Q8CHX7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rftn2Q8CHX7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rftn2Q8CHX7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rftn2Q8CHX7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rftn2Q8CHX7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rftn2Q8CHX7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rftn2Q8CHX7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rftn2Q8CHX7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rftn2Q8CHX7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rftn2Q8CHX7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rftn2Q8CHX7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rftn2Q8CHX7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rftn2Q8CHX7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rftn2Q8CHX7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rftn2Q8CHX7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rftn2Q8CHX7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rftn2Q8CHX7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rftn2Q8CHX7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rftn2Q8CHX7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rftn2Q8CHX7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rftn2Q8CHX7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rftn2Q8CHX7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rftn2Q8CHX7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rftn2Q8CHX7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rftn2Q8CHX7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rftn2Q8CHX7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rftn2Q8CHX7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rftn2Q8CHX7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rftn2Q8CHX7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Rftn2Q8CHX7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rftn2Q8CHX7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rftn2Q8CHX7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms