Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG7

Rapgef2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef2Q8CHG7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Rapgef2Q8CHG7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Rapgef2Q8CHG7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Rapgef2Q8CHG7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Rapgef2Q8CHG7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Rapgef2Q8CHG7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
Rapgef2Q8CHG7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
Rapgef2Q8CHG7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
Rapgef2Q8CHG7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Rapgef2Q8CHG7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Rapgef2Q8CHG7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
Rapgef2Q8CHG7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
Rapgef2Q8CHG7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
Rapgef2Q8CHG7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Rapgef2Q8CHG7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Rapgef2Q8CHG7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Rapgef2Q8CHG7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
Rapgef2Q8CHG7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Rapgef2Q8CHG7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Rapgef2Q8CHG7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Rapgef2Q8CHG7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Rapgef2Q8CHG7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC43.07■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Rapgef2Q8CHG7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Rapgef2Q8CHG7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Rapgef2Q8CHG7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Rapgef2Q8CHG7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Rapgef2Q8CHG7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Rapgef2Q8CHG7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Rapgef2Q8CHG7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Rapgef2Q8CHG7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Rapgef2Q8CHG7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Rapgef2Q8CHG7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Rapgef2Q8CHG7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Rapgef2Q8CHG7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Rapgef2Q8CHG7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Rapgef2Q8CHG7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Rapgef2Q8CHG7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Rapgef2Q8CHG7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Rapgef2Q8CHG7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Rapgef2Q8CHG7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Rapgef2Q8CHG7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Rapgef2Q8CHG7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
Rapgef2Q8CHG7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Rapgef2Q8CHG7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Rapgef2Q8CHG7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Rapgef2Q8CHG7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Rapgef2Q8CHG7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Rapgef2Q8CHG7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Rapgef2Q8CHG7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Rapgef2Q8CHG7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Rapgef2Q8CHG7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Rapgef2Q8CHG7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
Rapgef2Q8CHG7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Rapgef2Q8CHG7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Rapgef2Q8CHG7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Rapgef2Q8CHG7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Rapgef2Q8CHG7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Rapgef2Q8CHG7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Rapgef2Q8CHG7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Rapgef2Q8CHG7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Rapgef2Q8CHG7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Rapgef2Q8CHG7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Rapgef2Q8CHG7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Rapgef2Q8CHG7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Rapgef2Q8CHG7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Rapgef2Q8CHG7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Rapgef2Q8CHG7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Rapgef2Q8CHG7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Rapgef2Q8CHG7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Rapgef2Q8CHG7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Rapgef2Q8CHG7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Rapgef2Q8CHG7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Rapgef2Q8CHG7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Rapgef2Q8CHG7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Rapgef2Q8CHG7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Rapgef2Q8CHG7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Rapgef2Q8CHG7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Rapgef2Q8CHG7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Rapgef2Q8CHG7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Rapgef2Q8CHG7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Rapgef2Q8CHG7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Rapgef2Q8CHG7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Rapgef2Q8CHG7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Rapgef2Q8CHG7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Rapgef2Q8CHG7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Rapgef2Q8CHG7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Rapgef2Q8CHG7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Rapgef2Q8CHG7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rapgef2Q8CHG7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms