Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc49a3Q8CE47 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc49a3Q8CE47 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc49a3Q8CE47 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc49a3Q8CE47 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc49a3Q8CE47 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc49a3Q8CE47 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc49a3Q8CE47 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc49a3Q8CE47 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc49a3Q8CE47 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc49a3Q8CE47 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc49a3Q8CE47 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc49a3Q8CE47 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc49a3Q8CE47 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc49a3Q8CE47 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc49a3Q8CE47 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc49a3Q8CE47 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc49a3Q8CE47 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc49a3Q8CE47 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc49a3Q8CE47 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc49a3Q8CE47 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc49a3Q8CE47 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc49a3Q8CE47 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc49a3Q8CE47 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc49a3Q8CE47 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc49a3Q8CE47 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc49a3Q8CE47 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc49a3Q8CE47 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc49a3Q8CE47 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc49a3Q8CE47 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc49a3Q8CE47 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc49a3Q8CE47 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc49a3Q8CE47 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc49a3Q8CE47 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc49a3Q8CE47 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc49a3Q8CE47 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc49a3Q8CE47 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc49a3Q8CE47 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc49a3Q8CE47 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc49a3Q8CE47 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc49a3Q8CE47 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc49a3Q8CE47 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc49a3Q8CE47 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc49a3Q8CE47 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc49a3Q8CE47 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc49a3Q8CE47 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc49a3Q8CE47 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc49a3Q8CE47 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc49a3Q8CE47 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc49a3Q8CE47 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc49a3Q8CE47 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc49a3Q8CE47 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc49a3Q8CE47 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc49a3Q8CE47 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc49a3Q8CE47 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc49a3Q8CE47 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc49a3Q8CE47 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc49a3Q8CE47 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc49a3Q8CE47 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc49a3Q8CE47 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc49a3Q8CE47 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc49a3Q8CE47 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc49a3Q8CE47 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc49a3Q8CE47 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc49a3Q8CE47 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc49a3Q8CE47 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc49a3Q8CE47 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc49a3Q8CE47 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc49a3Q8CE47 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc49a3Q8CE47 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc49a3Q8CE47 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc49a3Q8CE47 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc49a3Q8CE47 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms