Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrif1Q8CDD9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrif1Q8CDD9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrif1Q8CDD9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrif1Q8CDD9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrif1Q8CDD9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrif1Q8CDD9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrif1Q8CDD9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrif1Q8CDD9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrif1Q8CDD9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrif1Q8CDD9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrif1Q8CDD9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrif1Q8CDD9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrif1Q8CDD9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrif1Q8CDD9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrif1Q8CDD9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrif1Q8CDD9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrif1Q8CDD9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrif1Q8CDD9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrif1Q8CDD9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrif1Q8CDD9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrif1Q8CDD9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrif1Q8CDD9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrif1Q8CDD9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrif1Q8CDD9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrif1Q8CDD9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrif1Q8CDD9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrif1Q8CDD9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrif1Q8CDD9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrif1Q8CDD9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrif1Q8CDD9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrif1Q8CDD9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrif1Q8CDD9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrif1Q8CDD9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrif1Q8CDD9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrif1Q8CDD9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrif1Q8CDD9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrif1Q8CDD9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrif1Q8CDD9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrif1Q8CDD9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrif1Q8CDD9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrif1Q8CDD9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrif1Q8CDD9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrif1Q8CDD9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrif1Q8CDD9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrif1Q8CDD9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrif1Q8CDD9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrif1Q8CDD9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrif1Q8CDD9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrif1Q8CDD9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrif1Q8CDD9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrif1Q8CDD9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrif1Q8CDD9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrif1Q8CDD9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrif1Q8CDD9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrif1Q8CDD9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrif1Q8CDD9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrif1Q8CDD9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrif1Q8CDD9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrif1Q8CDD9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrif1Q8CDD9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrif1Q8CDD9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrif1Q8CDD9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrif1Q8CDD9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrif1Q8CDD9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrif1Q8CDD9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrif1Q8CDD9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrif1Q8CDD9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrif1Q8CDD9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrif1Q8CDD9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrif1Q8CDD9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrif1Q8CDD9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrif1Q8CDD9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrif1Q8CDD9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrif1Q8CDD9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrif1Q8CDD9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrif1Q8CDD9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrif1Q8CDD9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrif1Q8CDD9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrif1Q8CDD9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrif1Q8CDD9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrif1Q8CDD9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrif1Q8CDD9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrif1Q8CDD9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrif1Q8CDD9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrif1Q8CDD9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrif1Q8CDD9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
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