Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ephb1Q8CBF3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ephb1Q8CBF3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ephb1Q8CBF3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ephb1Q8CBF3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ephb1Q8CBF3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ephb1Q8CBF3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ephb1Q8CBF3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ephb1Q8CBF3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ephb1Q8CBF3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ephb1Q8CBF3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ephb1Q8CBF3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ephb1Q8CBF3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ephb1Q8CBF3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ephb1Q8CBF3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ephb1Q8CBF3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ephb1Q8CBF3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ephb1Q8CBF3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ephb1Q8CBF3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ephb1Q8CBF3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ephb1Q8CBF3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ephb1Q8CBF3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ephb1Q8CBF3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ephb1Q8CBF3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ephb1Q8CBF3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ephb1Q8CBF3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ephb1Q8CBF3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ephb1Q8CBF3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ephb1Q8CBF3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ephb1Q8CBF3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ephb1Q8CBF3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ephb1Q8CBF3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ephb1Q8CBF3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ephb1Q8CBF3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ephb1Q8CBF3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ephb1Q8CBF3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ephb1Q8CBF3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ephb1Q8CBF3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ephb1Q8CBF3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ephb1Q8CBF3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ephb1Q8CBF3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ephb1Q8CBF3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ephb1Q8CBF3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ephb1Q8CBF3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ephb1Q8CBF3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ephb1Q8CBF3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ephb1Q8CBF3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ephb1Q8CBF3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ephb1Q8CBF3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ephb1Q8CBF3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ephb1Q8CBF3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ephb1Q8CBF3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ephb1Q8CBF3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ephb1Q8CBF3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ephb1Q8CBF3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ephb1Q8CBF3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ephb1Q8CBF3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ephb1Q8CBF3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ephb1Q8CBF3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ephb1Q8CBF3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ephb1Q8CBF3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ephb1Q8CBF3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ephb1Q8CBF3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ephb1Q8CBF3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ephb1Q8CBF3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ephb1Q8CBF3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ephb1Q8CBF3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ephb1Q8CBF3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ephb1Q8CBF3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ephb1Q8CBF3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ephb1Q8CBF3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ephb1Q8CBF3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ephb1Q8CBF3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ephb1Q8CBF3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ephb1Q8CBF3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ephb1Q8CBF3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ephb1Q8CBF3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ephb1Q8CBF3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ephb1Q8CBF3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ephb1Q8CBF3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ephb1Q8CBF3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ephb1Q8CBF3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ephb1Q8CBF3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ephb1Q8CBF3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ephb1Q8CBF3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ephb1Q8CBF3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ephb1Q8CBF3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ephb1Q8CBF3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ephb1Q8CBF3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ephb1Q8CBF3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ephb1Q8CBF3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ephb1Q8CBF3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ephb1Q8CBF3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ephb1Q8CBF3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ephb1Q8CBF3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms