Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Usp38Q8BW70 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp38Q8BW70 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp38Q8BW70 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp38Q8BW70 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp38Q8BW70 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp38Q8BW70 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp38Q8BW70 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp38Q8BW70 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp38Q8BW70 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp38Q8BW70 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp38Q8BW70 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp38Q8BW70 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp38Q8BW70 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp38Q8BW70 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp38Q8BW70 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp38Q8BW70 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp38Q8BW70 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp38Q8BW70 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp38Q8BW70 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp38Q8BW70 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp38Q8BW70 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp38Q8BW70 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp38Q8BW70 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp38Q8BW70 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp38Q8BW70 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp38Q8BW70 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp38Q8BW70 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp38Q8BW70 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp38Q8BW70 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp38Q8BW70 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp38Q8BW70 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp38Q8BW70 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp38Q8BW70 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp38Q8BW70 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp38Q8BW70 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp38Q8BW70 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp38Q8BW70 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp38Q8BW70 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp38Q8BW70 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp38Q8BW70 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp38Q8BW70 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp38Q8BW70 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp38Q8BW70 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp38Q8BW70 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp38Q8BW70 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp38Q8BW70 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp38Q8BW70 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp38Q8BW70 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp38Q8BW70 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp38Q8BW70 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp38Q8BW70 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp38Q8BW70 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp38Q8BW70 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp38Q8BW70 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp38Q8BW70 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp38Q8BW70 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp38Q8BW70 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp38Q8BW70 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp38Q8BW70 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp38Q8BW70 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Usp38Q8BW70 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp38Q8BW70 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp38Q8BW70 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp38Q8BW70 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp38Q8BW70 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp38Q8BW70 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp38Q8BW70 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp38Q8BW70 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp38Q8BW70 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp38Q8BW70 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp38Q8BW70 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp38Q8BW70 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp38Q8BW70 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp38Q8BW70 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp38Q8BW70 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp38Q8BW70 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp38Q8BW70 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp38Q8BW70 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp38Q8BW70 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp38Q8BW70 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp38Q8BW70 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp38Q8BW70 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp38Q8BW70 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp38Q8BW70 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp38Q8BW70 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
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