Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops7bQ8BV13 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops7bQ8BV13 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops7bQ8BV13 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops7bQ8BV13 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cops7bQ8BV13 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cops7bQ8BV13 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops7bQ8BV13 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cops7bQ8BV13 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cops7bQ8BV13 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops7bQ8BV13 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops7bQ8BV13 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cops7bQ8BV13 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cops7bQ8BV13 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cops7bQ8BV13 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cops7bQ8BV13 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cops7bQ8BV13 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cops7bQ8BV13 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cops7bQ8BV13 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cops7bQ8BV13 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops7bQ8BV13 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cops7bQ8BV13 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cops7bQ8BV13 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops7bQ8BV13 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops7bQ8BV13 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cops7bQ8BV13 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cops7bQ8BV13 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cops7bQ8BV13 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cops7bQ8BV13 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops7bQ8BV13 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cops7bQ8BV13 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cops7bQ8BV13 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops7bQ8BV13 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops7bQ8BV13 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cops7bQ8BV13 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops7bQ8BV13 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops7bQ8BV13 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops7bQ8BV13 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops7bQ8BV13 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cops7bQ8BV13 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cops7bQ8BV13 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cops7bQ8BV13 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cops7bQ8BV13 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops7bQ8BV13 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cops7bQ8BV13 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops7bQ8BV13 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops7bQ8BV13 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops7bQ8BV13 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops7bQ8BV13 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops7bQ8BV13 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops7bQ8BV13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops7bQ8BV13 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops7bQ8BV13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops7bQ8BV13 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops7bQ8BV13 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops7bQ8BV13 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops7bQ8BV13 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops7bQ8BV13 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops7bQ8BV13 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops7bQ8BV13 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops7bQ8BV13 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cops7bQ8BV13 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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