Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y37

CACUL1, CDK2-associated and cullin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACUL1Q86Y37 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACUL1Q86Y37 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACUL1Q86Y37 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACUL1Q86Y37 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CACUL1Q86Y37 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACUL1Q86Y37 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACUL1Q86Y37 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACUL1Q86Y37 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACUL1Q86Y37 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACUL1Q86Y37 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms