Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX32Q86XE0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX32Q86XE0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX32Q86XE0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX32Q86XE0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX32Q86XE0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX32Q86XE0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX32Q86XE0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX32Q86XE0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX32Q86XE0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX32Q86XE0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX32Q86XE0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX32Q86XE0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX32Q86XE0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX32Q86XE0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX32Q86XE0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX32Q86XE0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX32Q86XE0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX32Q86XE0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX32Q86XE0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX32Q86XE0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX32Q86XE0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX32Q86XE0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX32Q86XE0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX32Q86XE0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX32Q86XE0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX32Q86XE0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX32Q86XE0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX32Q86XE0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX32Q86XE0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX32Q86XE0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX32Q86XE0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SNX32Q86XE0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX32Q86XE0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX32Q86XE0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX32Q86XE0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX32Q86XE0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX32Q86XE0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX32Q86XE0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX32Q86XE0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX32Q86XE0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX32Q86XE0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX32Q86XE0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX32Q86XE0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX32Q86XE0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX32Q86XE0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX32Q86XE0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX32Q86XE0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX32Q86XE0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX32Q86XE0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX32Q86XE0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX32Q86XE0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX32Q86XE0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX32Q86XE0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX32Q86XE0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX32Q86XE0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX32Q86XE0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX32Q86XE0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX32Q86XE0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX32Q86XE0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX32Q86XE0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX32Q86XE0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms