Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNMB4Q86W47 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNMB4Q86W47 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNMB4Q86W47 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNMB4Q86W47 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNMB4Q86W47 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNMB4Q86W47 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNMB4Q86W47 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNMB4Q86W47 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNMB4Q86W47 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNMB4Q86W47 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNMB4Q86W47 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNMB4Q86W47 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMB4Q86W47 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMB4Q86W47 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMB4Q86W47 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNMB4Q86W47 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNMB4Q86W47 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNMB4Q86W47 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNMB4Q86W47 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNMB4Q86W47 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNMB4Q86W47 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNMB4Q86W47 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNMB4Q86W47 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNMB4Q86W47 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNMB4Q86W47 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNMB4Q86W47 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNMB4Q86W47 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNMB4Q86W47 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNMB4Q86W47 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNMB4Q86W47 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNMB4Q86W47 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNMB4Q86W47 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNMB4Q86W47 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNMB4Q86W47 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNMB4Q86W47 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNMB4Q86W47 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNMB4Q86W47 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
KCNMB4Q86W47 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KCNMB4Q86W47 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNMB4Q86W47 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNMB4Q86W47 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNMB4Q86W47 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMB4Q86W47 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMB4Q86W47 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMB4Q86W47 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMB4Q86W47 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNMB4Q86W47 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNMB4Q86W47 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNMB4Q86W47 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNMB4Q86W47 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNMB4Q86W47 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMB4Q86W47 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMB4Q86W47 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNMB4Q86W47 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNMB4Q86W47 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNMB4Q86W47 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMB4Q86W47 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMB4Q86W47 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNMB4Q86W47 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNMB4Q86W47 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNMB4Q86W47 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNMB4Q86W47 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNMB4Q86W47 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNMB4Q86W47 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNMB4Q86W47 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNMB4Q86W47 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNMB4Q86W47 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNMB4Q86W47 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNMB4Q86W47 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNMB4Q86W47 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNMB4Q86W47 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNMB4Q86W47 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNMB4Q86W47 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNMB4Q86W47 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNMB4Q86W47 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms