Protein–RNA interactions for Protein: Q86UL3

GPAT4, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT4Q86UL3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPAT4Q86UL3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPAT4Q86UL3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPAT4Q86UL3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPAT4Q86UL3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPAT4Q86UL3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPAT4Q86UL3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPAT4Q86UL3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPAT4Q86UL3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPAT4Q86UL3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAT4Q86UL3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAT4Q86UL3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAT4Q86UL3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAT4Q86UL3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAT4Q86UL3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAT4Q86UL3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAT4Q86UL3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAT4Q86UL3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAT4Q86UL3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAT4Q86UL3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAT4Q86UL3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAT4Q86UL3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAT4Q86UL3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPAT4Q86UL3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPAT4Q86UL3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPAT4Q86UL3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPAT4Q86UL3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPAT4Q86UL3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPAT4Q86UL3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPAT4Q86UL3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPAT4Q86UL3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPAT4Q86UL3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPAT4Q86UL3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPAT4Q86UL3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPAT4Q86UL3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPAT4Q86UL3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPAT4Q86UL3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPAT4Q86UL3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPAT4Q86UL3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPAT4Q86UL3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPAT4Q86UL3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPAT4Q86UL3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPAT4Q86UL3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPAT4Q86UL3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPAT4Q86UL3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAT4Q86UL3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAT4Q86UL3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAT4Q86UL3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAT4Q86UL3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAT4Q86UL3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAT4Q86UL3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAT4Q86UL3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPAT4Q86UL3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAT4Q86UL3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms