Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC190Q86UF4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC190Q86UF4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC190Q86UF4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC190Q86UF4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC190Q86UF4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC190Q86UF4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC190Q86UF4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC190Q86UF4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC190Q86UF4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC190Q86UF4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC190Q86UF4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC190Q86UF4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC190Q86UF4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC190Q86UF4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC190Q86UF4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC190Q86UF4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC190Q86UF4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC190Q86UF4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC190Q86UF4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC190Q86UF4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC190Q86UF4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC190Q86UF4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC190Q86UF4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC190Q86UF4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC190Q86UF4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC190Q86UF4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC190Q86UF4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC190Q86UF4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC190Q86UF4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC190Q86UF4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC190Q86UF4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC190Q86UF4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC190Q86UF4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC190Q86UF4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC190Q86UF4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC190Q86UF4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC190Q86UF4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC190Q86UF4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC190Q86UF4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC190Q86UF4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC190Q86UF4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC190Q86UF4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC190Q86UF4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC190Q86UF4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC190Q86UF4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC190Q86UF4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC190Q86UF4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC190Q86UF4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC190Q86UF4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC190Q86UF4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC190Q86UF4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC190Q86UF4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC190Q86UF4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC190Q86UF4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC190Q86UF4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC190Q86UF4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC190Q86UF4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC190Q86UF4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC190Q86UF4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC190Q86UF4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC190Q86UF4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC190Q86UF4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC190Q86UF4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC190Q86UF4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC190Q86UF4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC190Q86UF4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC190Q86UF4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC190Q86UF4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC190Q86UF4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC190Q86UF4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC190Q86UF4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC190Q86UF4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC190Q86UF4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC190Q86UF4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms