Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR3

Skida1, SKI/DACH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skida1Q80YR3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skida1Q80YR3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skida1Q80YR3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skida1Q80YR3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Skida1Q80YR3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skida1Q80YR3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skida1Q80YR3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Skida1Q80YR3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Skida1Q80YR3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skida1Q80YR3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skida1Q80YR3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skida1Q80YR3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skida1Q80YR3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skida1Q80YR3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skida1Q80YR3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skida1Q80YR3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skida1Q80YR3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skida1Q80YR3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skida1Q80YR3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Skida1Q80YR3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skida1Q80YR3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Skida1Q80YR3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Skida1Q80YR3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Skida1Q80YR3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Skida1Q80YR3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Skida1Q80YR3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skida1Q80YR3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skida1Q80YR3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skida1Q80YR3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skida1Q80YR3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Skida1Q80YR3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Skida1Q80YR3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skida1Q80YR3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skida1Q80YR3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skida1Q80YR3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skida1Q80YR3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skida1Q80YR3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skida1Q80YR3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Skida1Q80YR3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skida1Q80YR3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Skida1Q80YR3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skida1Q80YR3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skida1Q80YR3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skida1Q80YR3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skida1Q80YR3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skida1Q80YR3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skida1Q80YR3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skida1Q80YR3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skida1Q80YR3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Skida1Q80YR3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Skida1Q80YR3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Skida1Q80YR3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skida1Q80YR3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skida1Q80YR3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skida1Q80YR3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skida1Q80YR3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skida1Q80YR3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skida1Q80YR3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skida1Q80YR3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skida1Q80YR3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Skida1Q80YR3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skida1Q80YR3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skida1Q80YR3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skida1Q80YR3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skida1Q80YR3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skida1Q80YR3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skida1Q80YR3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skida1Q80YR3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skida1Q80YR3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skida1Q80YR3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skida1Q80YR3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skida1Q80YR3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skida1Q80YR3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skida1Q80YR3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skida1Q80YR3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skida1Q80YR3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skida1Q80YR3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms