Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nrde2Q80XC6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nrde2Q80XC6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nrde2Q80XC6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nrde2Q80XC6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nrde2Q80XC6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nrde2Q80XC6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nrde2Q80XC6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nrde2Q80XC6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nrde2Q80XC6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nrde2Q80XC6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nrde2Q80XC6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nrde2Q80XC6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nrde2Q80XC6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nrde2Q80XC6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nrde2Q80XC6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nrde2Q80XC6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nrde2Q80XC6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nrde2Q80XC6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nrde2Q80XC6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nrde2Q80XC6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Nrde2Q80XC6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nrde2Q80XC6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nrde2Q80XC6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nrde2Q80XC6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nrde2Q80XC6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nrde2Q80XC6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nrde2Q80XC6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nrde2Q80XC6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nrde2Q80XC6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nrde2Q80XC6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nrde2Q80XC6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nrde2Q80XC6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nrde2Q80XC6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nrde2Q80XC6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nrde2Q80XC6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nrde2Q80XC6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nrde2Q80XC6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nrde2Q80XC6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nrde2Q80XC6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nrde2Q80XC6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nrde2Q80XC6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nrde2Q80XC6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nrde2Q80XC6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nrde2Q80XC6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nrde2Q80XC6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nrde2Q80XC6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nrde2Q80XC6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nrde2Q80XC6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nrde2Q80XC6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nrde2Q80XC6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nrde2Q80XC6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nrde2Q80XC6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nrde2Q80XC6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nrde2Q80XC6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nrde2Q80XC6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nrde2Q80XC6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nrde2Q80XC6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nrde2Q80XC6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nrde2Q80XC6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nrde2Q80XC6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nrde2Q80XC6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nrde2Q80XC6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nrde2Q80XC6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nrde2Q80XC6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nrde2Q80XC6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nrde2Q80XC6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nrde2Q80XC6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nrde2Q80XC6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nrde2Q80XC6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nrde2Q80XC6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nrde2Q80XC6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nrde2Q80XC6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nrde2Q80XC6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nrde2Q80XC6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nrde2Q80XC6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nrde2Q80XC6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Nrde2Q80XC6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nrde2Q80XC6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nrde2Q80XC6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nrde2Q80XC6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nrde2Q80XC6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nrde2Q80XC6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nrde2Q80XC6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nrde2Q80XC6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nrde2Q80XC6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nrde2Q80XC6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nrde2Q80XC6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nrde2Q80XC6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nrde2Q80XC6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nrde2Q80XC6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nrde2Q80XC6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrde2Q80XC6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nrde2Q80XC6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrde2Q80XC6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrde2Q80XC6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrde2Q80XC6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrde2Q80XC6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrde2Q80XC6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrde2Q80XC6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms