Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Zbed4Q80WQ9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zbed4Q80WQ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zbed4Q80WQ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zbed4Q80WQ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zbed4Q80WQ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zbed4Q80WQ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zbed4Q80WQ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbed4Q80WQ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbed4Q80WQ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbed4Q80WQ9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbed4Q80WQ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbed4Q80WQ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zbed4Q80WQ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zbed4Q80WQ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zbed4Q80WQ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zbed4Q80WQ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zbed4Q80WQ9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zbed4Q80WQ9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zbed4Q80WQ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zbed4Q80WQ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zbed4Q80WQ9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zbed4Q80WQ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zbed4Q80WQ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zbed4Q80WQ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zbed4Q80WQ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zbed4Q80WQ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Zbed4Q80WQ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zbed4Q80WQ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zbed4Q80WQ9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zbed4Q80WQ9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Zbed4Q80WQ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zbed4Q80WQ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zbed4Q80WQ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zbed4Q80WQ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zbed4Q80WQ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zbed4Q80WQ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zbed4Q80WQ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zbed4Q80WQ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zbed4Q80WQ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Zbed4Q80WQ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zbed4Q80WQ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zbed4Q80WQ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zbed4Q80WQ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zbed4Q80WQ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zbed4Q80WQ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zbed4Q80WQ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zbed4Q80WQ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zbed4Q80WQ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zbed4Q80WQ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zbed4Q80WQ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zbed4Q80WQ9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zbed4Q80WQ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zbed4Q80WQ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Zbed4Q80WQ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zbed4Q80WQ9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zbed4Q80WQ9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zbed4Q80WQ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Zbed4Q80WQ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zbed4Q80WQ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zbed4Q80WQ9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zbed4Q80WQ9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zbed4Q80WQ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zbed4Q80WQ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zbed4Q80WQ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zbed4Q80WQ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zbed4Q80WQ9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zbed4Q80WQ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zbed4Q80WQ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zbed4Q80WQ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zbed4Q80WQ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zbed4Q80WQ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zbed4Q80WQ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zbed4Q80WQ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zbed4Q80WQ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zbed4Q80WQ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zbed4Q80WQ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zbed4Q80WQ9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zbed4Q80WQ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zbed4Q80WQ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zbed4Q80WQ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zbed4Q80WQ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zbed4Q80WQ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Zbed4Q80WQ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zbed4Q80WQ9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zbed4Q80WQ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zbed4Q80WQ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zbed4Q80WQ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zbed4Q80WQ9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zbed4Q80WQ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zbed4Q80WQ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zbed4Q80WQ9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zbed4Q80WQ9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zbed4Q80WQ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zbed4Q80WQ9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zbed4Q80WQ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zbed4Q80WQ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zbed4Q80WQ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms