Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Phf8Q80TJ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Phf8Q80TJ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Phf8Q80TJ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Phf8Q80TJ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Phf8Q80TJ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Phf8Q80TJ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Phf8Q80TJ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Phf8Q80TJ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Phf8Q80TJ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Phf8Q80TJ7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Phf8Q80TJ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Phf8Q80TJ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phf8Q80TJ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phf8Q80TJ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phf8Q80TJ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Phf8Q80TJ7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Phf8Q80TJ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Phf8Q80TJ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Phf8Q80TJ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Phf8Q80TJ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Phf8Q80TJ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Phf8Q80TJ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Phf8Q80TJ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phf8Q80TJ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Phf8Q80TJ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Phf8Q80TJ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Phf8Q80TJ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Phf8Q80TJ7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Phf8Q80TJ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Phf8Q80TJ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Phf8Q80TJ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Phf8Q80TJ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Phf8Q80TJ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Phf8Q80TJ7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Phf8Q80TJ7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Phf8Q80TJ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phf8Q80TJ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phf8Q80TJ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Phf8Q80TJ7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Phf8Q80TJ7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Phf8Q80TJ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phf8Q80TJ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phf8Q80TJ7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phf8Q80TJ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phf8Q80TJ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phf8Q80TJ7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phf8Q80TJ7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phf8Q80TJ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phf8Q80TJ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phf8Q80TJ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phf8Q80TJ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phf8Q80TJ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phf8Q80TJ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Phf8Q80TJ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phf8Q80TJ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phf8Q80TJ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phf8Q80TJ7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Phf8Q80TJ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phf8Q80TJ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phf8Q80TJ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phf8Q80TJ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Phf8Q80TJ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phf8Q80TJ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phf8Q80TJ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phf8Q80TJ7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phf8Q80TJ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf8Q80TJ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Phf8Q80TJ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phf8Q80TJ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phf8Q80TJ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phf8Q80TJ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phf8Q80TJ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phf8Q80TJ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phf8Q80TJ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phf8Q80TJ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phf8Q80TJ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phf8Q80TJ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phf8Q80TJ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phf8Q80TJ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phf8Q80TJ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phf8Q80TJ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phf8Q80TJ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phf8Q80TJ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phf8Q80TJ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phf8Q80TJ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phf8Q80TJ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phf8Q80TJ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf8Q80TJ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms