Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rexo1Q7TT28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rexo1Q7TT28 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rexo1Q7TT28 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rexo1Q7TT28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Rexo1Q7TT28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rexo1Q7TT28 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rexo1Q7TT28 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rexo1Q7TT28 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rexo1Q7TT28 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rexo1Q7TT28 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rexo1Q7TT28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rexo1Q7TT28 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rexo1Q7TT28 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rexo1Q7TT28 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rexo1Q7TT28 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rexo1Q7TT28 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rexo1Q7TT28 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rexo1Q7TT28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rexo1Q7TT28 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rexo1Q7TT28 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rexo1Q7TT28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rexo1Q7TT28 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rexo1Q7TT28 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rexo1Q7TT28 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rexo1Q7TT28 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rexo1Q7TT28 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rexo1Q7TT28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rexo1Q7TT28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rexo1Q7TT28 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rexo1Q7TT28 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rexo1Q7TT28 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rexo1Q7TT28 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rexo1Q7TT28 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rexo1Q7TT28 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rexo1Q7TT28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rexo1Q7TT28 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rexo1Q7TT28 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rexo1Q7TT28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rexo1Q7TT28 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rexo1Q7TT28 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rexo1Q7TT28 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rexo1Q7TT28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rexo1Q7TT28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rexo1Q7TT28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rexo1Q7TT28 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rexo1Q7TT28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rexo1Q7TT28 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rexo1Q7TT28 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rexo1Q7TT28 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rexo1Q7TT28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rexo1Q7TT28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rexo1Q7TT28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rexo1Q7TT28 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rexo1Q7TT28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rexo1Q7TT28 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rexo1Q7TT28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rexo1Q7TT28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rexo1Q7TT28 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rexo1Q7TT28 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rexo1Q7TT28 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rexo1Q7TT28 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rexo1Q7TT28 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rexo1Q7TT28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rexo1Q7TT28 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rexo1Q7TT28 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rexo1Q7TT28 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rexo1Q7TT28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rexo1Q7TT28 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rexo1Q7TT28 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Rexo1Q7TT28 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rexo1Q7TT28 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rexo1Q7TT28 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rexo1Q7TT28 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rexo1Q7TT28 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rexo1Q7TT28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rexo1Q7TT28 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rexo1Q7TT28 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rexo1Q7TT28 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rexo1Q7TT28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rexo1Q7TT28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rexo1Q7TT28 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rexo1Q7TT28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rexo1Q7TT28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rexo1Q7TT28 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rexo1Q7TT28 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rexo1Q7TT28 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rexo1Q7TT28 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rexo1Q7TT28 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms