Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dsg1cQ7TSF0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dsg1cQ7TSF0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dsg1cQ7TSF0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dsg1cQ7TSF0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg1cQ7TSF0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsg1cQ7TSF0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsg1cQ7TSF0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg1cQ7TSF0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg1cQ7TSF0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dsg1cQ7TSF0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dsg1cQ7TSF0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dsg1cQ7TSF0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg1cQ7TSF0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg1cQ7TSF0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dsg1cQ7TSF0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dsg1cQ7TSF0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dsg1cQ7TSF0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dsg1cQ7TSF0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dsg1cQ7TSF0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dsg1cQ7TSF0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dsg1cQ7TSF0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dsg1cQ7TSF0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dsg1cQ7TSF0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dsg1cQ7TSF0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dsg1cQ7TSF0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dsg1cQ7TSF0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dsg1cQ7TSF0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dsg1cQ7TSF0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dsg1cQ7TSF0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg1cQ7TSF0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg1cQ7TSF0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg1cQ7TSF0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dsg1cQ7TSF0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dsg1cQ7TSF0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg1cQ7TSF0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg1cQ7TSF0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dsg1cQ7TSF0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dsg1cQ7TSF0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dsg1cQ7TSF0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dsg1cQ7TSF0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dsg1cQ7TSF0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg1cQ7TSF0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg1cQ7TSF0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg1cQ7TSF0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg1cQ7TSF0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dsg1cQ7TSF0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg1cQ7TSF0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dsg1cQ7TSF0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dsg1cQ7TSF0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dsg1cQ7TSF0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg1cQ7TSF0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg1cQ7TSF0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dsg1cQ7TSF0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dsg1cQ7TSF0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dsg1cQ7TSF0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dsg1cQ7TSF0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dsg1cQ7TSF0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dsg1cQ7TSF0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dsg1cQ7TSF0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg1cQ7TSF0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg1cQ7TSF0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg1cQ7TSF0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dsg1cQ7TSF0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg1cQ7TSF0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg1cQ7TSF0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg1cQ7TSF0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg1cQ7TSF0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dsg1cQ7TSF0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dsg1cQ7TSF0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dsg1cQ7TSF0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dsg1cQ7TSF0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dsg1cQ7TSF0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dsg1cQ7TSF0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg1cQ7TSF0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dsg1cQ7TSF0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg1cQ7TSF0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg1cQ7TSF0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.2 ms