Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LnpkQ7TQ95 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LnpkQ7TQ95 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LnpkQ7TQ95 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LnpkQ7TQ95 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LnpkQ7TQ95 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LnpkQ7TQ95 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LnpkQ7TQ95 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LnpkQ7TQ95 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LnpkQ7TQ95 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LnpkQ7TQ95 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LnpkQ7TQ95 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LnpkQ7TQ95 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LnpkQ7TQ95 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LnpkQ7TQ95 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LnpkQ7TQ95 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LnpkQ7TQ95 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LnpkQ7TQ95 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LnpkQ7TQ95 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LnpkQ7TQ95 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LnpkQ7TQ95 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LnpkQ7TQ95 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LnpkQ7TQ95 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LnpkQ7TQ95 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LnpkQ7TQ95 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LnpkQ7TQ95 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LnpkQ7TQ95 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LnpkQ7TQ95 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LnpkQ7TQ95 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LnpkQ7TQ95 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LnpkQ7TQ95 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LnpkQ7TQ95 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LnpkQ7TQ95 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LnpkQ7TQ95 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LnpkQ7TQ95 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LnpkQ7TQ95 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LnpkQ7TQ95 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LnpkQ7TQ95 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LnpkQ7TQ95 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LnpkQ7TQ95 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LnpkQ7TQ95 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LnpkQ7TQ95 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LnpkQ7TQ95 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LnpkQ7TQ95 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LnpkQ7TQ95 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LnpkQ7TQ95 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LnpkQ7TQ95 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LnpkQ7TQ95 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LnpkQ7TQ95 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LnpkQ7TQ95 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LnpkQ7TQ95 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LnpkQ7TQ95 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LnpkQ7TQ95 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LnpkQ7TQ95 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LnpkQ7TQ95 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LnpkQ7TQ95 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LnpkQ7TQ95 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LnpkQ7TQ95 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LnpkQ7TQ95 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LnpkQ7TQ95 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LnpkQ7TQ95 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LnpkQ7TQ95 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LnpkQ7TQ95 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LnpkQ7TQ95 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LnpkQ7TQ95 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LnpkQ7TQ95 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LnpkQ7TQ95 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LnpkQ7TQ95 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LnpkQ7TQ95 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LnpkQ7TQ95 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LnpkQ7TQ95 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LnpkQ7TQ95 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LnpkQ7TQ95 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LnpkQ7TQ95 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LnpkQ7TQ95 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LnpkQ7TQ95 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LnpkQ7TQ95 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LnpkQ7TQ95 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LnpkQ7TQ95 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LnpkQ7TQ95 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LnpkQ7TQ95 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LnpkQ7TQ95 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LnpkQ7TQ95 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LnpkQ7TQ95 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LnpkQ7TQ95 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LnpkQ7TQ95 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LnpkQ7TQ95 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LnpkQ7TQ95 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LnpkQ7TQ95 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LnpkQ7TQ95 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LnpkQ7TQ95 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LnpkQ7TQ95 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LnpkQ7TQ95 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LnpkQ7TQ95 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LnpkQ7TQ95 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LnpkQ7TQ95 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LnpkQ7TQ95 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LnpkQ7TQ95 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LnpkQ7TQ95 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LnpkQ7TQ95 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms