Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
OTOP3Q7RTS5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
OTOP3Q7RTS5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
OTOP3Q7RTS5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
OTOP3Q7RTS5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
OTOP3Q7RTS5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
OTOP3Q7RTS5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
OTOP3Q7RTS5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
OTOP3Q7RTS5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
OTOP3Q7RTS5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
OTOP3Q7RTS5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
OTOP3Q7RTS5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
OTOP3Q7RTS5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
OTOP3Q7RTS5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
OTOP3Q7RTS5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
OTOP3Q7RTS5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
OTOP3Q7RTS5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
OTOP3Q7RTS5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
OTOP3Q7RTS5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OTOP3Q7RTS5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
OTOP3Q7RTS5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
OTOP3Q7RTS5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
OTOP3Q7RTS5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTOP3Q7RTS5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OTOP3Q7RTS5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
OTOP3Q7RTS5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
OTOP3Q7RTS5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
OTOP3Q7RTS5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OTOP3Q7RTS5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
OTOP3Q7RTS5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
OTOP3Q7RTS5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
OTOP3Q7RTS5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OTOP3Q7RTS5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTOP3Q7RTS5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTOP3Q7RTS5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
OTOP3Q7RTS5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
OTOP3Q7RTS5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
OTOP3Q7RTS5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
OTOP3Q7RTS5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
OTOP3Q7RTS5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OTOP3Q7RTS5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
OTOP3Q7RTS5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
OTOP3Q7RTS5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
OTOP3Q7RTS5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
OTOP3Q7RTS5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
OTOP3Q7RTS5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
OTOP3Q7RTS5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
OTOP3Q7RTS5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOP3Q7RTS5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOP3Q7RTS5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOP3Q7RTS5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OTOP3Q7RTS5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
OTOP3Q7RTS5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
OTOP3Q7RTS5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOP3Q7RTS5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOP3Q7RTS5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOP3Q7RTS5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOP3Q7RTS5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
OTOP3Q7RTS5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OTOP3Q7RTS5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms