Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP1BQ7LBR1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP1BQ7LBR1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP1BQ7LBR1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP1BQ7LBR1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP1BQ7LBR1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP1BQ7LBR1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP1BQ7LBR1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP1BQ7LBR1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMP1BQ7LBR1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP1BQ7LBR1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP1BQ7LBR1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMP1BQ7LBR1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP1BQ7LBR1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMP1BQ7LBR1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMP1BQ7LBR1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMP1BQ7LBR1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMP1BQ7LBR1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP1BQ7LBR1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP1BQ7LBR1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP1BQ7LBR1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMP1BQ7LBR1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMP1BQ7LBR1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHMP1BQ7LBR1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMP1BQ7LBR1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP1BQ7LBR1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP1BQ7LBR1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP1BQ7LBR1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP1BQ7LBR1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP1BQ7LBR1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP1BQ7LBR1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP1BQ7LBR1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP1BQ7LBR1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP1BQ7LBR1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP1BQ7LBR1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP1BQ7LBR1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP1BQ7LBR1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP1BQ7LBR1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP1BQ7LBR1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP1BQ7LBR1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP1BQ7LBR1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP1BQ7LBR1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP1BQ7LBR1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP1BQ7LBR1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP1BQ7LBR1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP1BQ7LBR1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP1BQ7LBR1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP1BQ7LBR1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP1BQ7LBR1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP1BQ7LBR1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP1BQ7LBR1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP1BQ7LBR1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP1BQ7LBR1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP1BQ7LBR1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP1BQ7LBR1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP1BQ7LBR1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP1BQ7LBR1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP1BQ7LBR1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP1BQ7LBR1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP1BQ7LBR1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP1BQ7LBR1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP1BQ7LBR1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP1BQ7LBR1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP1BQ7LBR1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP1BQ7LBR1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP1BQ7LBR1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP1BQ7LBR1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP1BQ7LBR1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP1BQ7LBR1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP1BQ7LBR1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms