Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GDPD3Q7L5L3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GDPD3Q7L5L3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDPD3Q7L5L3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDPD3Q7L5L3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDPD3Q7L5L3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDPD3Q7L5L3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDPD3Q7L5L3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDPD3Q7L5L3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDPD3Q7L5L3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDPD3Q7L5L3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GDPD3Q7L5L3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDPD3Q7L5L3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDPD3Q7L5L3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDPD3Q7L5L3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDPD3Q7L5L3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDPD3Q7L5L3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDPD3Q7L5L3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDPD3Q7L5L3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDPD3Q7L5L3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDPD3Q7L5L3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDPD3Q7L5L3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDPD3Q7L5L3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDPD3Q7L5L3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDPD3Q7L5L3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDPD3Q7L5L3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDPD3Q7L5L3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDPD3Q7L5L3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDPD3Q7L5L3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDPD3Q7L5L3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDPD3Q7L5L3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDPD3Q7L5L3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDPD3Q7L5L3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDPD3Q7L5L3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDPD3Q7L5L3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD3Q7L5L3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD3Q7L5L3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD3Q7L5L3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDPD3Q7L5L3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDPD3Q7L5L3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDPD3Q7L5L3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDPD3Q7L5L3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDPD3Q7L5L3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDPD3Q7L5L3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDPD3Q7L5L3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDPD3Q7L5L3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDPD3Q7L5L3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDPD3Q7L5L3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDPD3Q7L5L3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDPD3Q7L5L3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDPD3Q7L5L3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDPD3Q7L5L3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDPD3Q7L5L3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDPD3Q7L5L3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDPD3Q7L5L3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDPD3Q7L5L3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDPD3Q7L5L3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDPD3Q7L5L3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDPD3Q7L5L3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD3Q7L5L3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD3Q7L5L3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD3Q7L5L3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD3Q7L5L3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD3Q7L5L3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPD3Q7L5L3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPD3Q7L5L3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDPD3Q7L5L3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPD3Q7L5L3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPD3Q7L5L3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPD3Q7L5L3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD3Q7L5L3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPD3Q7L5L3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPD3Q7L5L3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPD3Q7L5L3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPD3Q7L5L3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPD3Q7L5L3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPD3Q7L5L3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms