Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYS1Q717R9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYS1Q717R9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYS1Q717R9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYS1Q717R9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYS1Q717R9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYS1Q717R9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYS1Q717R9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYS1Q717R9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYS1Q717R9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYS1Q717R9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYS1Q717R9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYS1Q717R9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYS1Q717R9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CYS1Q717R9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CYS1Q717R9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYS1Q717R9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYS1Q717R9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYS1Q717R9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYS1Q717R9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYS1Q717R9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYS1Q717R9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYS1Q717R9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYS1Q717R9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYS1Q717R9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYS1Q717R9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYS1Q717R9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYS1Q717R9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYS1Q717R9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYS1Q717R9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYS1Q717R9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYS1Q717R9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYS1Q717R9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYS1Q717R9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYS1Q717R9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYS1Q717R9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYS1Q717R9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYS1Q717R9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYS1Q717R9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYS1Q717R9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYS1Q717R9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CYS1Q717R9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYS1Q717R9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CYS1Q717R9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYS1Q717R9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYS1Q717R9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYS1Q717R9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CYS1Q717R9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYS1Q717R9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYS1Q717R9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYS1Q717R9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYS1Q717R9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYS1Q717R9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYS1Q717R9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYS1Q717R9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYS1Q717R9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYS1Q717R9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYS1Q717R9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CYS1Q717R9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYS1Q717R9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYS1Q717R9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYS1Q717R9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYS1Q717R9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYS1Q717R9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYS1Q717R9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYS1Q717R9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYS1Q717R9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYS1Q717R9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYS1Q717R9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYS1Q717R9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CYS1Q717R9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYS1Q717R9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYS1Q717R9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYS1Q717R9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms