Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z53

FRA10AC1, Protein FRA10AC1, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRA10AC1Q70Z53 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRA10AC1Q70Z53 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRA10AC1Q70Z53 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRA10AC1Q70Z53 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRA10AC1Q70Z53 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRA10AC1Q70Z53 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRA10AC1Q70Z53 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRA10AC1Q70Z53 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRA10AC1Q70Z53 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRA10AC1Q70Z53 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRA10AC1Q70Z53 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FRA10AC1Q70Z53 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRA10AC1Q70Z53 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRA10AC1Q70Z53 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRA10AC1Q70Z53 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRA10AC1Q70Z53 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRA10AC1Q70Z53 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRA10AC1Q70Z53 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRA10AC1Q70Z53 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRA10AC1Q70Z53 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRA10AC1Q70Z53 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRA10AC1Q70Z53 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRA10AC1Q70Z53 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRA10AC1Q70Z53 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FRA10AC1Q70Z53 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRA10AC1Q70Z53 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FRA10AC1Q70Z53 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRA10AC1Q70Z53 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRA10AC1Q70Z53 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRA10AC1Q70Z53 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRA10AC1Q70Z53 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRA10AC1Q70Z53 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRA10AC1Q70Z53 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRA10AC1Q70Z53 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRA10AC1Q70Z53 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRA10AC1Q70Z53 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRA10AC1Q70Z53 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRA10AC1Q70Z53 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRA10AC1Q70Z53 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRA10AC1Q70Z53 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRA10AC1Q70Z53 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRA10AC1Q70Z53 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRA10AC1Q70Z53 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRA10AC1Q70Z53 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRA10AC1Q70Z53 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRA10AC1Q70Z53 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRA10AC1Q70Z53 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRA10AC1Q70Z53 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRA10AC1Q70Z53 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRA10AC1Q70Z53 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRA10AC1Q70Z53 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms