Protein–RNA interactions for Protein: Q70SY1

CREB3L2, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L2Q70SY1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L2Q70SY1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L2Q70SY1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L2Q70SY1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L2Q70SY1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L2Q70SY1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB3L2Q70SY1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L2Q70SY1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L2Q70SY1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L2Q70SY1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB3L2Q70SY1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L2Q70SY1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3L2Q70SY1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L2Q70SY1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3L2Q70SY1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3L2Q70SY1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3L2Q70SY1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L2Q70SY1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3L2Q70SY1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3L2Q70SY1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3L2Q70SY1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3L2Q70SY1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L2Q70SY1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L2Q70SY1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L2Q70SY1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3L2Q70SY1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3L2Q70SY1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3L2Q70SY1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3L2Q70SY1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L2Q70SY1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L2Q70SY1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L2Q70SY1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L2Q70SY1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L2Q70SY1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L2Q70SY1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L2Q70SY1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L2Q70SY1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L2Q70SY1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L2Q70SY1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L2Q70SY1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L2Q70SY1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L2Q70SY1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L2Q70SY1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L2Q70SY1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L2Q70SY1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L2Q70SY1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L2Q70SY1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L2Q70SY1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L2Q70SY1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L2Q70SY1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L2Q70SY1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L2Q70SY1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L2Q70SY1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L2Q70SY1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CREB3L2Q70SY1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L2Q70SY1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L2Q70SY1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L2Q70SY1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L2Q70SY1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L2Q70SY1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L2Q70SY1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L2Q70SY1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L2Q70SY1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L2Q70SY1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L2Q70SY1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L2Q70SY1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L2Q70SY1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L2Q70SY1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L2Q70SY1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms