Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC149Q6ZUS6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC149Q6ZUS6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC149Q6ZUS6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC149Q6ZUS6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC149Q6ZUS6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC149Q6ZUS6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC149Q6ZUS6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC149Q6ZUS6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC149Q6ZUS6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC149Q6ZUS6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC149Q6ZUS6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC149Q6ZUS6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC149Q6ZUS6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC149Q6ZUS6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC149Q6ZUS6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC149Q6ZUS6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC149Q6ZUS6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC149Q6ZUS6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC149Q6ZUS6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC149Q6ZUS6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC149Q6ZUS6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC149Q6ZUS6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC149Q6ZUS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC149Q6ZUS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC149Q6ZUS6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC149Q6ZUS6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC149Q6ZUS6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC149Q6ZUS6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC149Q6ZUS6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC149Q6ZUS6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC149Q6ZUS6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC149Q6ZUS6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC149Q6ZUS6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC149Q6ZUS6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC149Q6ZUS6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC149Q6ZUS6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC149Q6ZUS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC149Q6ZUS6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC149Q6ZUS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC149Q6ZUS6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC149Q6ZUS6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC149Q6ZUS6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC149Q6ZUS6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC149Q6ZUS6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC149Q6ZUS6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC149Q6ZUS6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC149Q6ZUS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC149Q6ZUS6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC149Q6ZUS6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC149Q6ZUS6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC149Q6ZUS6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC149Q6ZUS6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC149Q6ZUS6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC149Q6ZUS6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC149Q6ZUS6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC149Q6ZUS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC149Q6ZUS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC149Q6ZUS6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC149Q6ZUS6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC149Q6ZUS6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC149Q6ZUS6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC149Q6ZUS6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC149Q6ZUS6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC149Q6ZUS6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC149Q6ZUS6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC149Q6ZUS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC149Q6ZUS6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC149Q6ZUS6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC149Q6ZUS6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC149Q6ZUS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC149Q6ZUS6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC149Q6ZUS6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC149Q6ZUS6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC149Q6ZUS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC149Q6ZUS6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC149Q6ZUS6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC149Q6ZUS6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC149Q6ZUS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC149Q6ZUS6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC149Q6ZUS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms