Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHISA6Q6ZSJ9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHISA6Q6ZSJ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHISA6Q6ZSJ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA6Q6ZSJ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA6Q6ZSJ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA6Q6ZSJ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA6Q6ZSJ9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHISA6Q6ZSJ9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA6Q6ZSJ9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA6Q6ZSJ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA6Q6ZSJ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA6Q6ZSJ9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA6Q6ZSJ9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA6Q6ZSJ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHISA6Q6ZSJ9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHISA6Q6ZSJ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHISA6Q6ZSJ9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHISA6Q6ZSJ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA6Q6ZSJ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA6Q6ZSJ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA6Q6ZSJ9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA6Q6ZSJ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA6Q6ZSJ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHISA6Q6ZSJ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHISA6Q6ZSJ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA6Q6ZSJ9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA6Q6ZSJ9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA6Q6ZSJ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA6Q6ZSJ9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA6Q6ZSJ9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA6Q6ZSJ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA6Q6ZSJ9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA6Q6ZSJ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA6Q6ZSJ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SHISA6Q6ZSJ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA6Q6ZSJ9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA6Q6ZSJ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA6Q6ZSJ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA6Q6ZSJ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA6Q6ZSJ9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA6Q6ZSJ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA6Q6ZSJ9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA6Q6ZSJ9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA6Q6ZSJ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA6Q6ZSJ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHISA6Q6ZSJ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHISA6Q6ZSJ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA6Q6ZSJ9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA6Q6ZSJ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA6Q6ZSJ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA6Q6ZSJ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA6Q6ZSJ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHISA6Q6ZSJ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHISA6Q6ZSJ9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA6Q6ZSJ9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA6Q6ZSJ9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA6Q6ZSJ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA6Q6ZSJ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA6Q6ZSJ9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA6Q6ZSJ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA6Q6ZSJ9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA6Q6ZSJ9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA6Q6ZSJ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA6Q6ZSJ9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA6Q6ZSJ9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHISA6Q6ZSJ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHISA6Q6ZSJ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHISA6Q6ZSJ9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA6Q6ZSJ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA6Q6ZSJ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA6Q6ZSJ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHISA6Q6ZSJ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA6Q6ZSJ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms