Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Ncapd3Q6ZQK0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Ncapd3Q6ZQK0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Ncapd3Q6ZQK0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ncapd3Q6ZQK0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Ncapd3Q6ZQK0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ncapd3Q6ZQK0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Ncapd3Q6ZQK0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Ncapd3Q6ZQK0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Ncapd3Q6ZQK0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Ncapd3Q6ZQK0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Ncapd3Q6ZQK0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Ncapd3Q6ZQK0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Ncapd3Q6ZQK0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Ncapd3Q6ZQK0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Ncapd3Q6ZQK0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Ncapd3Q6ZQK0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Ncapd3Q6ZQK0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Ncapd3Q6ZQK0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Ncapd3Q6ZQK0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Ncapd3Q6ZQK0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Ncapd3Q6ZQK0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Ncapd3Q6ZQK0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Ncapd3Q6ZQK0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
Ncapd3Q6ZQK0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Ncapd3Q6ZQK0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Ncapd3Q6ZQK0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Ncapd3Q6ZQK0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Ncapd3Q6ZQK0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Ncapd3Q6ZQK0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ncapd3Q6ZQK0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Ncapd3Q6ZQK0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ncapd3Q6ZQK0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ncapd3Q6ZQK0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Ncapd3Q6ZQK0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Ncapd3Q6ZQK0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ncapd3Q6ZQK0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Ncapd3Q6ZQK0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ncapd3Q6ZQK0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ncapd3Q6ZQK0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ncapd3Q6ZQK0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Ncapd3Q6ZQK0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ncapd3Q6ZQK0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ncapd3Q6ZQK0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ncapd3Q6ZQK0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC40.07■■■■■ 4
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Ncapd3Q6ZQK0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Ncapd3Q6ZQK0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Ncapd3Q6ZQK0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Ncapd3Q6ZQK0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Ncapd3Q6ZQK0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ncapd3Q6ZQK0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ncapd3Q6ZQK0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ncapd3Q6ZQK0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ncapd3Q6ZQK0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Ncapd3Q6ZQK0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Ncapd3Q6ZQK0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Ncapd3Q6ZQK0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Ncapd3Q6ZQK0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Ncapd3Q6ZQK0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Ncapd3Q6ZQK0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Ncapd3Q6ZQK0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Ncapd3Q6ZQK0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Ncapd3Q6ZQK0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Ncapd3Q6ZQK0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Ncapd3Q6ZQK0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms