Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF7

Jade2, E3 ubiquitin-protein ligase Jade-2, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jade2Q6ZQF7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Jade2Q6ZQF7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Jade2Q6ZQF7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Jade2Q6ZQF7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Jade2Q6ZQF7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Jade2Q6ZQF7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Jade2Q6ZQF7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Jade2Q6ZQF7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Jade2Q6ZQF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Jade2Q6ZQF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Jade2Q6ZQF7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Jade2Q6ZQF7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Jade2Q6ZQF7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Jade2Q6ZQF7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Jade2Q6ZQF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Jade2Q6ZQF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Jade2Q6ZQF7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Jade2Q6ZQF7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Jade2Q6ZQF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Jade2Q6ZQF7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Jade2Q6ZQF7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Jade2Q6ZQF7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Jade2Q6ZQF7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Jade2Q6ZQF7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Jade2Q6ZQF7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Jade2Q6ZQF7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Jade2Q6ZQF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Jade2Q6ZQF7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Jade2Q6ZQF7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Jade2Q6ZQF7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Jade2Q6ZQF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Jade2Q6ZQF7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Jade2Q6ZQF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Jade2Q6ZQF7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Jade2Q6ZQF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Jade2Q6ZQF7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Jade2Q6ZQF7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Jade2Q6ZQF7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Jade2Q6ZQF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Jade2Q6ZQF7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Jade2Q6ZQF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Jade2Q6ZQF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Jade2Q6ZQF7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Jade2Q6ZQF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Jade2Q6ZQF7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Jade2Q6ZQF7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Jade2Q6ZQF7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Jade2Q6ZQF7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Jade2Q6ZQF7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Jade2Q6ZQF7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Jade2Q6ZQF7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Jade2Q6ZQF7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Jade2Q6ZQF7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Jade2Q6ZQF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Jade2Q6ZQF7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Jade2Q6ZQF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Jade2Q6ZQF7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Jade2Q6ZQF7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Jade2Q6ZQF7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Jade2Q6ZQF7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Jade2Q6ZQF7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Jade2Q6ZQF7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Jade2Q6ZQF7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Jade2Q6ZQF7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Jade2Q6ZQF7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Jade2Q6ZQF7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Jade2Q6ZQF7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Jade2Q6ZQF7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jade2Q6ZQF7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jade2Q6ZQF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Jade2Q6ZQF7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jade2Q6ZQF7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Jade2Q6ZQF7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Jade2Q6ZQF7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Jade2Q6ZQF7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Jade2Q6ZQF7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Jade2Q6ZQF7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Jade2Q6ZQF7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Jade2Q6ZQF7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Jade2Q6ZQF7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Jade2Q6ZQF7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Jade2Q6ZQF7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Jade2Q6ZQF7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Jade2Q6ZQF7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Jade2Q6ZQF7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Jade2Q6ZQF7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Jade2Q6ZQF7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Jade2Q6ZQF7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Jade2Q6ZQF7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.5 ms