Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PDZRN4Q6ZMN7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDZRN4Q6ZMN7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDZRN4Q6ZMN7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDZRN4Q6ZMN7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDZRN4Q6ZMN7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDZRN4Q6ZMN7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDZRN4Q6ZMN7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDZRN4Q6ZMN7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDZRN4Q6ZMN7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDZRN4Q6ZMN7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDZRN4Q6ZMN7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PDZRN4Q6ZMN7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDZRN4Q6ZMN7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDZRN4Q6ZMN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDZRN4Q6ZMN7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDZRN4Q6ZMN7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDZRN4Q6ZMN7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDZRN4Q6ZMN7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDZRN4Q6ZMN7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDZRN4Q6ZMN7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDZRN4Q6ZMN7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDZRN4Q6ZMN7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDZRN4Q6ZMN7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDZRN4Q6ZMN7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDZRN4Q6ZMN7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PDZRN4Q6ZMN7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDZRN4Q6ZMN7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PDZRN4Q6ZMN7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDZRN4Q6ZMN7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PDZRN4Q6ZMN7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PDZRN4Q6ZMN7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDZRN4Q6ZMN7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDZRN4Q6ZMN7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDZRN4Q6ZMN7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDZRN4Q6ZMN7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDZRN4Q6ZMN7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PDZRN4Q6ZMN7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDZRN4Q6ZMN7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PDZRN4Q6ZMN7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDZRN4Q6ZMN7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDZRN4Q6ZMN7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDZRN4Q6ZMN7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDZRN4Q6ZMN7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDZRN4Q6ZMN7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDZRN4Q6ZMN7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDZRN4Q6ZMN7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PDZRN4Q6ZMN7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDZRN4Q6ZMN7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDZRN4Q6ZMN7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDZRN4Q6ZMN7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDZRN4Q6ZMN7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDZRN4Q6ZMN7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDZRN4Q6ZMN7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDZRN4Q6ZMN7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDZRN4Q6ZMN7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDZRN4Q6ZMN7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDZRN4Q6ZMN7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDZRN4Q6ZMN7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDZRN4Q6ZMN7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDZRN4Q6ZMN7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDZRN4Q6ZMN7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDZRN4Q6ZMN7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDZRN4Q6ZMN7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDZRN4Q6ZMN7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDZRN4Q6ZMN7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDZRN4Q6ZMN7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms