Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CD109Q6YHK3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
CD109Q6YHK3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
CD109Q6YHK3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CD109Q6YHK3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
CD109Q6YHK3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
CD109Q6YHK3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
CD109Q6YHK3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CD109Q6YHK3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CD109Q6YHK3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
CD109Q6YHK3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CD109Q6YHK3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
CD109Q6YHK3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
CD109Q6YHK3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
CD109Q6YHK3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
CD109Q6YHK3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
CD109Q6YHK3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
CD109Q6YHK3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
CD109Q6YHK3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CD109Q6YHK3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CD109Q6YHK3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CD109Q6YHK3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
CD109Q6YHK3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CD109Q6YHK3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
CD109Q6YHK3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CD109Q6YHK3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
CD109Q6YHK3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
CD109Q6YHK3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
CD109Q6YHK3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
CD109Q6YHK3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
CD109Q6YHK3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
CD109Q6YHK3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CD109Q6YHK3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
CD109Q6YHK3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
CD109Q6YHK3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CD109Q6YHK3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CD109Q6YHK3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CD109Q6YHK3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CD109Q6YHK3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CD109Q6YHK3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CD109Q6YHK3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CD109Q6YHK3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CD109Q6YHK3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CD109Q6YHK3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CD109Q6YHK3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CD109Q6YHK3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
CD109Q6YHK3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CD109Q6YHK3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CD109Q6YHK3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
CD109Q6YHK3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CD109Q6YHK3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CD109Q6YHK3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CD109Q6YHK3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
CD109Q6YHK3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CD109Q6YHK3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CD109Q6YHK3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CD109Q6YHK3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CD109Q6YHK3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CD109Q6YHK3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CD109Q6YHK3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CD109Q6YHK3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CD109Q6YHK3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
CD109Q6YHK3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CD109Q6YHK3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CD109Q6YHK3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CD109Q6YHK3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CD109Q6YHK3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CD109Q6YHK3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CD109Q6YHK3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CD109Q6YHK3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CD109Q6YHK3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
CD109Q6YHK3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CD109Q6YHK3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CD109Q6YHK3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.35■■■■■ 4.53
CD109Q6YHK3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CD109Q6YHK3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CD109Q6YHK3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CD109Q6YHK3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CD109Q6YHK3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CD109Q6YHK3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CD109Q6YHK3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CD109Q6YHK3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CD109Q6YHK3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CD109Q6YHK3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CD109Q6YHK3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CD109Q6YHK3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CD109Q6YHK3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CD109Q6YHK3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CD109Q6YHK3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
CD109Q6YHK3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
CD109Q6YHK3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CD109Q6YHK3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CD109Q6YHK3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CD109Q6YHK3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CD109Q6YHK3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CD109Q6YHK3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CD109Q6YHK3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CD109Q6YHK3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CD109Q6YHK3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CD109Q6YHK3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms