Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P4ha3Q6W3F0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P4ha3Q6W3F0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P4ha3Q6W3F0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P4ha3Q6W3F0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P4ha3Q6W3F0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P4ha3Q6W3F0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P4ha3Q6W3F0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha3Q6W3F0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha3Q6W3F0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha3Q6W3F0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha3Q6W3F0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha3Q6W3F0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha3Q6W3F0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P4ha3Q6W3F0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha3Q6W3F0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha3Q6W3F0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha3Q6W3F0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha3Q6W3F0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha3Q6W3F0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha3Q6W3F0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha3Q6W3F0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P4ha3Q6W3F0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha3Q6W3F0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha3Q6W3F0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P4ha3Q6W3F0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P4ha3Q6W3F0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P4ha3Q6W3F0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P4ha3Q6W3F0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P4ha3Q6W3F0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P4ha3Q6W3F0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P4ha3Q6W3F0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P4ha3Q6W3F0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P4ha3Q6W3F0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P4ha3Q6W3F0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P4ha3Q6W3F0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P4ha3Q6W3F0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P4ha3Q6W3F0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P4ha3Q6W3F0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P4ha3Q6W3F0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P4ha3Q6W3F0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P4ha3Q6W3F0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P4ha3Q6W3F0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P4ha3Q6W3F0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P4ha3Q6W3F0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P4ha3Q6W3F0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P4ha3Q6W3F0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P4ha3Q6W3F0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P4ha3Q6W3F0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P4ha3Q6W3F0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
P4ha3Q6W3F0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P4ha3Q6W3F0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P4ha3Q6W3F0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P4ha3Q6W3F0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P4ha3Q6W3F0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P4ha3Q6W3F0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P4ha3Q6W3F0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P4ha3Q6W3F0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P4ha3Q6W3F0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
P4ha3Q6W3F0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P4ha3Q6W3F0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P4ha3Q6W3F0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P4ha3Q6W3F0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P4ha3Q6W3F0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms