Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXU4

GSG1L, Germ cell-specific gene 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1LQ6UXU4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSG1LQ6UXU4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSG1LQ6UXU4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSG1LQ6UXU4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSG1LQ6UXU4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSG1LQ6UXU4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms