Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VSTM1Q6UX27 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VSTM1Q6UX27 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VSTM1Q6UX27 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
VSTM1Q6UX27 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VSTM1Q6UX27 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VSTM1Q6UX27 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VSTM1Q6UX27 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VSTM1Q6UX27 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VSTM1Q6UX27 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VSTM1Q6UX27 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VSTM1Q6UX27 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VSTM1Q6UX27 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VSTM1Q6UX27 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VSTM1Q6UX27 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VSTM1Q6UX27 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VSTM1Q6UX27 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VSTM1Q6UX27 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VSTM1Q6UX27 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VSTM1Q6UX27 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VSTM1Q6UX27 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VSTM1Q6UX27 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
VSTM1Q6UX27 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VSTM1Q6UX27 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VSTM1Q6UX27 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VSTM1Q6UX27 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VSTM1Q6UX27 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VSTM1Q6UX27 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VSTM1Q6UX27 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VSTM1Q6UX27 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VSTM1Q6UX27 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VSTM1Q6UX27 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VSTM1Q6UX27 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VSTM1Q6UX27 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VSTM1Q6UX27 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VSTM1Q6UX27 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VSTM1Q6UX27 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
VSTM1Q6UX27 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VSTM1Q6UX27 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VSTM1Q6UX27 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VSTM1Q6UX27 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VSTM1Q6UX27 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VSTM1Q6UX27 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VSTM1Q6UX27 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VSTM1Q6UX27 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VSTM1Q6UX27 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VSTM1Q6UX27 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VSTM1Q6UX27 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VSTM1Q6UX27 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VSTM1Q6UX27 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VSTM1Q6UX27 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
VSTM1Q6UX27 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VSTM1Q6UX27 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VSTM1Q6UX27 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VSTM1Q6UX27 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VSTM1Q6UX27 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VSTM1Q6UX27 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VSTM1Q6UX27 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VSTM1Q6UX27 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VSTM1Q6UX27 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VSTM1Q6UX27 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VSTM1Q6UX27 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VSTM1Q6UX27 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VSTM1Q6UX27 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms