Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C16orf54Q6UWD8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C16orf54Q6UWD8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C16orf54Q6UWD8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C16orf54Q6UWD8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C16orf54Q6UWD8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C16orf54Q6UWD8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf54Q6UWD8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C16orf54Q6UWD8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C16orf54Q6UWD8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C16orf54Q6UWD8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C16orf54Q6UWD8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C16orf54Q6UWD8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C16orf54Q6UWD8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C16orf54Q6UWD8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C16orf54Q6UWD8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C16orf54Q6UWD8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C16orf54Q6UWD8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C16orf54Q6UWD8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C16orf54Q6UWD8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C16orf54Q6UWD8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C16orf54Q6UWD8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
C16orf54Q6UWD8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C16orf54Q6UWD8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms