Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RHBDF2Q6PJF5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RHBDF2Q6PJF5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RHBDF2Q6PJF5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RHBDF2Q6PJF5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RHBDF2Q6PJF5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RHBDF2Q6PJF5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RHBDF2Q6PJF5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RHBDF2Q6PJF5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RHBDF2Q6PJF5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RHBDF2Q6PJF5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RHBDF2Q6PJF5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RHBDF2Q6PJF5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RHBDF2Q6PJF5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RHBDF2Q6PJF5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RHBDF2Q6PJF5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDF2Q6PJF5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDF2Q6PJF5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RHBDF2Q6PJF5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RHBDF2Q6PJF5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RHBDF2Q6PJF5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RHBDF2Q6PJF5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RHBDF2Q6PJF5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHBDF2Q6PJF5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHBDF2Q6PJF5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RHBDF2Q6PJF5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RHBDF2Q6PJF5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RHBDF2Q6PJF5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RHBDF2Q6PJF5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RHBDF2Q6PJF5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RHBDF2Q6PJF5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RHBDF2Q6PJF5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RHBDF2Q6PJF5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RHBDF2Q6PJF5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RHBDF2Q6PJF5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RHBDF2Q6PJF5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RHBDF2Q6PJF5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RHBDF2Q6PJF5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RHBDF2Q6PJF5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RHBDF2Q6PJF5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RHBDF2Q6PJF5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RHBDF2Q6PJF5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RHBDF2Q6PJF5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RHBDF2Q6PJF5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RHBDF2Q6PJF5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RHBDF2Q6PJF5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RHBDF2Q6PJF5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RHBDF2Q6PJF5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RHBDF2Q6PJF5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RHBDF2Q6PJF5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RHBDF2Q6PJF5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RHBDF2Q6PJF5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RHBDF2Q6PJF5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RHBDF2Q6PJF5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RHBDF2Q6PJF5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHBDF2Q6PJF5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHBDF2Q6PJF5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RHBDF2Q6PJF5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RHBDF2Q6PJF5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RHBDF2Q6PJF5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RHBDF2Q6PJF5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHBDF2Q6PJF5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHBDF2Q6PJF5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHBDF2Q6PJF5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RHBDF2Q6PJF5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms