Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM88Q6PEY1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM88Q6PEY1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM88Q6PEY1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM88Q6PEY1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM88Q6PEY1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM88Q6PEY1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM88Q6PEY1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM88Q6PEY1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM88Q6PEY1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM88Q6PEY1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM88Q6PEY1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM88Q6PEY1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM88Q6PEY1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM88Q6PEY1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM88Q6PEY1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM88Q6PEY1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM88Q6PEY1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM88Q6PEY1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM88Q6PEY1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM88Q6PEY1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM88Q6PEY1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM88Q6PEY1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM88Q6PEY1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM88Q6PEY1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM88Q6PEY1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM88Q6PEY1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM88Q6PEY1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM88Q6PEY1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM88Q6PEY1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM88Q6PEY1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM88Q6PEY1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88Q6PEY1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88Q6PEY1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88Q6PEY1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88Q6PEY1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88Q6PEY1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88Q6PEY1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM88Q6PEY1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM88Q6PEY1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM88Q6PEY1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM88Q6PEY1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM88Q6PEY1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM88Q6PEY1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM88Q6PEY1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM88Q6PEY1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM88Q6PEY1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM88Q6PEY1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM88Q6PEY1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM88Q6PEY1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM88Q6PEY1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM88Q6PEY1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM88Q6PEY1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM88Q6PEY1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM88Q6PEY1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM88Q6PEY1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM88Q6PEY1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM88Q6PEY1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM88Q6PEY1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms