Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarcc2Q6PDG5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarcc2Q6PDG5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smarcc2Q6PDG5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarcc2Q6PDG5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Smarcc2Q6PDG5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarcc2Q6PDG5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarcc2Q6PDG5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarcc2Q6PDG5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Smarcc2Q6PDG5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarcc2Q6PDG5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarcc2Q6PDG5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarcc2Q6PDG5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarcc2Q6PDG5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarcc2Q6PDG5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarcc2Q6PDG5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarcc2Q6PDG5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarcc2Q6PDG5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Smarcc2Q6PDG5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarcc2Q6PDG5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarcc2Q6PDG5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarcc2Q6PDG5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarcc2Q6PDG5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarcc2Q6PDG5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarcc2Q6PDG5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Smarcc2Q6PDG5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarcc2Q6PDG5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Smarcc2Q6PDG5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Smarcc2Q6PDG5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarcc2Q6PDG5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarcc2Q6PDG5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarcc2Q6PDG5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarcc2Q6PDG5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarcc2Q6PDG5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarcc2Q6PDG5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarcc2Q6PDG5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Smarcc2Q6PDG5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarcc2Q6PDG5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarcc2Q6PDG5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarcc2Q6PDG5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarcc2Q6PDG5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarcc2Q6PDG5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarcc2Q6PDG5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarcc2Q6PDG5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarcc2Q6PDG5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarcc2Q6PDG5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smarcc2Q6PDG5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarcc2Q6PDG5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smarcc2Q6PDG5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarcc2Q6PDG5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smarcc2Q6PDG5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smarcc2Q6PDG5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smarcc2Q6PDG5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarcc2Q6PDG5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smarcc2Q6PDG5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarcc2Q6PDG5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarcc2Q6PDG5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarcc2Q6PDG5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarcc2Q6PDG5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarcc2Q6PDG5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarcc2Q6PDG5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarcc2Q6PDG5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarcc2Q6PDG5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarcc2Q6PDG5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarcc2Q6PDG5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarcc2Q6PDG5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarcc2Q6PDG5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarcc2Q6PDG5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarcc2Q6PDG5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarcc2Q6PDG5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarcc2Q6PDG5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarcc2Q6PDG5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarcc2Q6PDG5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarcc2Q6PDG5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarcc2Q6PDG5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarcc2Q6PDG5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarcc2Q6PDG5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarcc2Q6PDG5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarcc2Q6PDG5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarcc2Q6PDG5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarcc2Q6PDG5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarcc2Q6PDG5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarcc2Q6PDG5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarcc2Q6PDG5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarcc2Q6PDG5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarcc2Q6PDG5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarcc2Q6PDG5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarcc2Q6PDG5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarcc2Q6PDG5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarcc2Q6PDG5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarcc2Q6PDG5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarcc2Q6PDG5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarcc2Q6PDG5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarcc2Q6PDG5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Smarcc2Q6PDG5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms