Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D4

Cep135, Centrosomal protein of 135 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep135Q6P5D4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cep135Q6P5D4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cep135Q6P5D4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep135Q6P5D4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep135Q6P5D4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep135Q6P5D4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep135Q6P5D4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep135Q6P5D4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep135Q6P5D4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep135Q6P5D4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cep135Q6P5D4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cep135Q6P5D4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cep135Q6P5D4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Cep135Q6P5D4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep135Q6P5D4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep135Q6P5D4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep135Q6P5D4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep135Q6P5D4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep135Q6P5D4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep135Q6P5D4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep135Q6P5D4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cep135Q6P5D4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cep135Q6P5D4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cep135Q6P5D4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cep135Q6P5D4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cep135Q6P5D4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cep135Q6P5D4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cep135Q6P5D4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cep135Q6P5D4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cep135Q6P5D4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cep135Q6P5D4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cep135Q6P5D4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep135Q6P5D4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep135Q6P5D4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep135Q6P5D4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cep135Q6P5D4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cep135Q6P5D4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cep135Q6P5D4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep135Q6P5D4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep135Q6P5D4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cep135Q6P5D4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cep135Q6P5D4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cep135Q6P5D4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cep135Q6P5D4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cep135Q6P5D4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cep135Q6P5D4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cep135Q6P5D4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cep135Q6P5D4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cep135Q6P5D4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cep135Q6P5D4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cep135Q6P5D4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cep135Q6P5D4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cep135Q6P5D4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cep135Q6P5D4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cep135Q6P5D4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cep135Q6P5D4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cep135Q6P5D4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Cep135Q6P5D4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cep135Q6P5D4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cep135Q6P5D4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cep135Q6P5D4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cep135Q6P5D4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep135Q6P5D4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep135Q6P5D4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep135Q6P5D4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep135Q6P5D4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cep135Q6P5D4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep135Q6P5D4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cep135Q6P5D4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cep135Q6P5D4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cep135Q6P5D4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cep135Q6P5D4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cep135Q6P5D4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cep135Q6P5D4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cep135Q6P5D4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cep135Q6P5D4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cep135Q6P5D4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cep135Q6P5D4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cep135Q6P5D4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cep135Q6P5D4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cep135Q6P5D4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cep135Q6P5D4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep135Q6P5D4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep135Q6P5D4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep135Q6P5D4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep135Q6P5D4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cep135Q6P5D4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cep135Q6P5D4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cep135Q6P5D4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep135Q6P5D4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep135Q6P5D4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep135Q6P5D4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep135Q6P5D4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cep135Q6P5D4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep135Q6P5D4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep135Q6P5D4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep135Q6P5D4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cep135Q6P5D4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cep135Q6P5D4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cep135Q6P5D4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms