Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASC4Q6P4E1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASC4Q6P4E1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASC4Q6P4E1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASC4Q6P4E1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASC4Q6P4E1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASC4Q6P4E1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASC4Q6P4E1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASC4Q6P4E1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASC4Q6P4E1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASC4Q6P4E1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASC4Q6P4E1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASC4Q6P4E1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASC4Q6P4E1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASC4Q6P4E1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASC4Q6P4E1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASC4Q6P4E1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASC4Q6P4E1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASC4Q6P4E1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASC4Q6P4E1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASC4Q6P4E1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASC4Q6P4E1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASC4Q6P4E1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC4Q6P4E1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC4Q6P4E1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASC4Q6P4E1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASC4Q6P4E1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASC4Q6P4E1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASC4Q6P4E1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC4Q6P4E1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASC4Q6P4E1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASC4Q6P4E1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASC4Q6P4E1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC4Q6P4E1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASC4Q6P4E1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASC4Q6P4E1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASC4Q6P4E1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASC4Q6P4E1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CASC4Q6P4E1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CASC4Q6P4E1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CASC4Q6P4E1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CASC4Q6P4E1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASC4Q6P4E1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASC4Q6P4E1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASC4Q6P4E1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASC4Q6P4E1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASC4Q6P4E1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC4Q6P4E1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASC4Q6P4E1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC4Q6P4E1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASC4Q6P4E1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASC4Q6P4E1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CASC4Q6P4E1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CASC4Q6P4E1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC4Q6P4E1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASC4Q6P4E1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASC4Q6P4E1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC4Q6P4E1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASC4Q6P4E1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASC4Q6P4E1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASC4Q6P4E1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC4Q6P4E1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASC4Q6P4E1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASC4Q6P4E1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASC4Q6P4E1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CASC4Q6P4E1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms