Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PMF1Q6P1K2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PMF1Q6P1K2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PMF1Q6P1K2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PMF1Q6P1K2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PMF1Q6P1K2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PMF1Q6P1K2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PMF1Q6P1K2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PMF1Q6P1K2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PMF1Q6P1K2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PMF1Q6P1K2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PMF1Q6P1K2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PMF1Q6P1K2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PMF1Q6P1K2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PMF1Q6P1K2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PMF1Q6P1K2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PMF1Q6P1K2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PMF1Q6P1K2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PMF1Q6P1K2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PMF1Q6P1K2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PMF1Q6P1K2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PMF1Q6P1K2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PMF1Q6P1K2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PMF1Q6P1K2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PMF1Q6P1K2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PMF1Q6P1K2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PMF1Q6P1K2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PMF1Q6P1K2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PMF1Q6P1K2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PMF1Q6P1K2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PMF1Q6P1K2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PMF1Q6P1K2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PMF1Q6P1K2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PMF1Q6P1K2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PMF1Q6P1K2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PMF1Q6P1K2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PMF1Q6P1K2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PMF1Q6P1K2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PMF1Q6P1K2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PMF1Q6P1K2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PMF1Q6P1K2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PMF1Q6P1K2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PMF1Q6P1K2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PMF1Q6P1K2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PMF1Q6P1K2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PMF1Q6P1K2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PMF1Q6P1K2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PMF1Q6P1K2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PMF1Q6P1K2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PMF1Q6P1K2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PMF1Q6P1K2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms