Protein–RNA interactions for Protein: Q6JPI3

Med13l, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, mousemouse

Predictions only

Length 2,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13lQ6JPI3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med13lQ6JPI3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med13lQ6JPI3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med13lQ6JPI3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med13lQ6JPI3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Med13lQ6JPI3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med13lQ6JPI3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med13lQ6JPI3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med13lQ6JPI3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med13lQ6JPI3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med13lQ6JPI3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med13lQ6JPI3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med13lQ6JPI3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med13lQ6JPI3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med13lQ6JPI3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med13lQ6JPI3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med13lQ6JPI3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med13lQ6JPI3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med13lQ6JPI3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Med13lQ6JPI3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med13lQ6JPI3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Med13lQ6JPI3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med13lQ6JPI3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med13lQ6JPI3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med13lQ6JPI3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med13lQ6JPI3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med13lQ6JPI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Med13lQ6JPI3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med13lQ6JPI3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med13lQ6JPI3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med13lQ6JPI3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med13lQ6JPI3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med13lQ6JPI3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med13lQ6JPI3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med13lQ6JPI3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med13lQ6JPI3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Med13lQ6JPI3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med13lQ6JPI3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med13lQ6JPI3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med13lQ6JPI3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Med13lQ6JPI3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med13lQ6JPI3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Med13lQ6JPI3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med13lQ6JPI3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med13lQ6JPI3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med13lQ6JPI3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med13lQ6JPI3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Med13lQ6JPI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med13lQ6JPI3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med13lQ6JPI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med13lQ6JPI3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med13lQ6JPI3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med13lQ6JPI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med13lQ6JPI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med13lQ6JPI3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med13lQ6JPI3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med13lQ6JPI3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Med13lQ6JPI3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med13lQ6JPI3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med13lQ6JPI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med13lQ6JPI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Med13lQ6JPI3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med13lQ6JPI3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med13lQ6JPI3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med13lQ6JPI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med13lQ6JPI3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med13lQ6JPI3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Med13lQ6JPI3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med13lQ6JPI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med13lQ6JPI3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med13lQ6JPI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med13lQ6JPI3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med13lQ6JPI3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med13lQ6JPI3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med13lQ6JPI3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med13lQ6JPI3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med13lQ6JPI3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med13lQ6JPI3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med13lQ6JPI3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Med13lQ6JPI3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med13lQ6JPI3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med13lQ6JPI3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med13lQ6JPI3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med13lQ6JPI3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med13lQ6JPI3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med13lQ6JPI3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms