Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CENPPQ6IPU0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CENPPQ6IPU0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPPQ6IPU0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPPQ6IPU0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPPQ6IPU0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CENPPQ6IPU0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CENPPQ6IPU0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CENPPQ6IPU0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CENPPQ6IPU0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CENPPQ6IPU0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CENPPQ6IPU0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPPQ6IPU0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPPQ6IPU0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPPQ6IPU0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPPQ6IPU0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPPQ6IPU0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPPQ6IPU0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CENPPQ6IPU0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CENPPQ6IPU0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CENPPQ6IPU0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CENPPQ6IPU0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CENPPQ6IPU0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CENPPQ6IPU0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CENPPQ6IPU0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPPQ6IPU0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPPQ6IPU0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CENPPQ6IPU0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CENPPQ6IPU0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CENPPQ6IPU0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPPQ6IPU0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPPQ6IPU0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPPQ6IPU0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPPQ6IPU0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CENPPQ6IPU0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CENPPQ6IPU0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CENPPQ6IPU0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPPQ6IPU0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPPQ6IPU0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPPQ6IPU0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPPQ6IPU0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPPQ6IPU0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPPQ6IPU0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPPQ6IPU0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPPQ6IPU0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPPQ6IPU0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CENPPQ6IPU0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CENPPQ6IPU0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CENPPQ6IPU0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CENPPQ6IPU0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CENPPQ6IPU0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CENPPQ6IPU0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CENPPQ6IPU0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CENPPQ6IPU0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CENPPQ6IPU0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CENPPQ6IPU0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPPQ6IPU0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CENPPQ6IPU0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CENPPQ6IPU0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CENPPQ6IPU0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CENPPQ6IPU0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CENPPQ6IPU0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CENPPQ6IPU0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CENPPQ6IPU0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CENPPQ6IPU0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CENPPQ6IPU0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPPQ6IPU0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPPQ6IPU0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CENPPQ6IPU0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPPQ6IPU0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CENPPQ6IPU0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPPQ6IPU0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CENPPQ6IPU0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CENPPQ6IPU0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CENPPQ6IPU0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CENPPQ6IPU0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms