Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ScapQ6GQT6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ScapQ6GQT6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ScapQ6GQT6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ScapQ6GQT6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ScapQ6GQT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ScapQ6GQT6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ScapQ6GQT6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ScapQ6GQT6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ScapQ6GQT6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ScapQ6GQT6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ScapQ6GQT6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ScapQ6GQT6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ScapQ6GQT6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ScapQ6GQT6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ScapQ6GQT6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ScapQ6GQT6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ScapQ6GQT6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ScapQ6GQT6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ScapQ6GQT6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ScapQ6GQT6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ScapQ6GQT6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ScapQ6GQT6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ScapQ6GQT6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ScapQ6GQT6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ScapQ6GQT6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ScapQ6GQT6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ScapQ6GQT6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ScapQ6GQT6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ScapQ6GQT6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ScapQ6GQT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ScapQ6GQT6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ScapQ6GQT6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ScapQ6GQT6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ScapQ6GQT6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ScapQ6GQT6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ScapQ6GQT6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ScapQ6GQT6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ScapQ6GQT6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ScapQ6GQT6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ScapQ6GQT6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ScapQ6GQT6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ScapQ6GQT6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ScapQ6GQT6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ScapQ6GQT6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ScapQ6GQT6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ScapQ6GQT6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ScapQ6GQT6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ScapQ6GQT6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ScapQ6GQT6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ScapQ6GQT6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ScapQ6GQT6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ScapQ6GQT6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ScapQ6GQT6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ScapQ6GQT6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ScapQ6GQT6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ScapQ6GQT6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ScapQ6GQT6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ScapQ6GQT6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ScapQ6GQT6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ScapQ6GQT6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ScapQ6GQT6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ScapQ6GQT6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ScapQ6GQT6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ScapQ6GQT6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ScapQ6GQT6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ScapQ6GQT6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ScapQ6GQT6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ScapQ6GQT6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ScapQ6GQT6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ScapQ6GQT6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ScapQ6GQT6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ScapQ6GQT6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ScapQ6GQT6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ScapQ6GQT6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ScapQ6GQT6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ScapQ6GQT6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ScapQ6GQT6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ScapQ6GQT6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ScapQ6GQT6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ScapQ6GQT6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ScapQ6GQT6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ScapQ6GQT6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ScapQ6GQT6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ScapQ6GQT6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ScapQ6GQT6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ScapQ6GQT6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ScapQ6GQT6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ScapQ6GQT6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms